Entre los principales biomas o sub-ecosistemas acuáticos tenemos:
Biomas de agua dulce;
- Lagunas, lagos y humedales.
- Ríos y arroyos.
Biomas de agua marina;
- Océanos.
- Zonas Intermareales.
- Arrecifes de coral.
- Bosques laminariales.
Biomas Salobres;
- Estuarios.
- Marismas
- Manglares
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